WEKO3
インデックスリンク
アイテム
{"_buckets": {"deposit": "fe6a7185-17fe-4542-864a-f1eec6e1af33"}, "_deposit": {"created_by": 18, "id": "54148", "owners": [18], "pid": {"revision_id": 0, "type": "depid", "value": "54148"}, "status": "published"}, "_oai": {"id": "oai:kanazawa-u.repo.nii.ac.jp:00054148", "sets": ["2828"]}, "author_link": ["2346"], "item_9_biblio_info_8": {"attribute_name": "書誌情報", "attribute_value_mlt": [{"bibliographicIssueDates": {"bibliographicIssueDate": "2016-04-21", "bibliographicIssueDateType": "Issued"}, "bibliographicPageStart": "1p.", "bibliographicVolumeNumber": "2004 – 2005", "bibliographic_titles": [{"bibliographic_title": "平成17(2005)年度 科学研究費補助金 萌芽研究 研究概要"}, {"bibliographic_title": "2005 Research Project Summary", "bibliographic_titleLang": "en"}]}]}, "item_9_creator_33": {"attribute_name": "著者別表示", "attribute_type": "creator", "attribute_value_mlt": [{"creatorNames": [{"creatorName": "Sakurai, Takeshi"}], "nameIdentifiers": [{"nameIdentifier": "2346", "nameIdentifierScheme": "WEKO"}, {"nameIdentifier": "90116038", "nameIdentifierScheme": "e-Rad", "nameIdentifierURI": "https://kaken.nii.ac.jp/ja/search/?qm=90116038"}]}]}, "item_9_description_21": {"attribute_name": "抄録", "attribute_value_mlt": [{"subitem_description": "脱窒菌Halomonas halodenitrificansはヘムcを有する小サブユニットNorCと低スピンヘムb,高スピンヘムb_3および非ヘム鉄を有する大サブユニットNorBからなるヘテロダイマーコンプレックスである。大腸菌を宿主としてNorCを異種発現したところ,N末の膜アンカーが切断された状態で発現したが,ヘムcを含む部分には影響なく,電子移動機能を有していた。同様に,NorBを大腸菌を宿主として異種発現させたが,一酸化窒素還元機能は示さず,サブユニットの個別発現には成功しなかった。そこで,NorBの発現には,成熟酵素には存在しないORFがコードするNorQ, NorDが関係すると考え,この遺伝子も含めて発現系を構築したが,機能のある酵素は発現しなかった。次いで,H.halodenitrificans遺伝子がコードする総てのNOR遺伝子,NorC, NorB, NorQ, NorDを含んだ異種発現系を構築したところ,オーセンティックなNorと同じ吸収,MCD, ESRスペクトルを示す組換え体が得られた。この組換え体のNO還元活性を測定したところ,微弱ながら,活性を示し,世界で初めてNorの異種発現に成功した。次いで,Norが末端酸化酵素へと分子進化する過程を再現するため,非ヘム鉄を銅結合部位に変異させることを計画し,Norとチトクロムオキシダーゼのキメラ酵素の作成を試みたが,キメラ酵素は高次構造を適切にとることが出来なかった。この解決方法として,組換え体を点変異させることが計画されるが,異種発現体は酵素の収量が低いことから,研究期間内ではミュータントの作成までには至らなかった。異種及び同種発現によるミュータント作成は新しい大きなテーマとして設定する計画である。", "subitem_description_type": "Abstract"}]}, "item_9_description_22": {"attribute_name": "内容記述", "attribute_value_mlt": [{"subitem_description": "研究課題/領域番号:16655069, 研究期間(年度):2004 – 2005", "subitem_description_type": "Other"}, {"subitem_description": "出典:「一酸化窒素還元から酸素還元への変換による呼吸酵素の分子進化」研究成果報告書 課題番号16655069\n(KAKEN:科学研究費助成事業データベース(国立情報学研究所))\n(https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-16655069/)を加工して作成", "subitem_description_type": "Other"}]}, "item_9_description_5": {"attribute_name": "提供者所属", "attribute_value_mlt": [{"subitem_description": "金沢大学金沢大学理工研究域物質化学系", "subitem_description_type": "Other"}]}, "item_9_identifier_registration": {"attribute_name": "ID登録", "attribute_value_mlt": [{"subitem_identifier_reg_text": "10.24517/00060425", "subitem_identifier_reg_type": "JaLC"}]}, "item_9_relation_28": {"attribute_name": "関連URI", "attribute_value_mlt": [{"subitem_relation_name": [{"subitem_relation_name_text": "https://kaken.nii.ac.jp/ja/search/?kw=90116038"}], "subitem_relation_type_id": {"subitem_relation_type_id_text": "https://kaken.nii.ac.jp/ja/search/?kw=90116038", "subitem_relation_type_select": "URI"}}, {"subitem_relation_name": [{"subitem_relation_name_text": "https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-16655069/"}], "subitem_relation_type_id": {"subitem_relation_type_id_text": "https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-16655069/", "subitem_relation_type_select": "URI"}}]}, "item_9_version_type_25": {"attribute_name": "著者版フラグ", "attribute_value_mlt": [{"subitem_version_resource": "http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa", "subitem_version_type": "AM"}]}, "item_creator": {"attribute_name": "著者", "attribute_type": "creator", "attribute_value_mlt": [{"creatorNames": [{"creatorName": "櫻井, 武 "}], "nameIdentifiers": [{"nameIdentifier": "2346", "nameIdentifierScheme": "WEKO"}, {"nameIdentifier": "90116038", "nameIdentifierScheme": "e-Rad", "nameIdentifierURI": "https://kaken.nii.ac.jp/ja/search/?qm=90116038"}]}]}, "item_files": {"attribute_name": "ファイル情報", "attribute_type": "file", "attribute_value_mlt": [{"accessrole": "open_date", "date": [{"dateType": "Available", "dateValue": "2021-02-22"}], "displaytype": "detail", "download_preview_message": "", "file_order": 0, "filename": "SC-PR-SAKURAI-T-kaken -1p.pdf", "filesize": [{"value": "136.7 kB"}], "format": "application/pdf", "future_date_message": "", "is_thumbnail": false, "licensetype": "license_11", "mimetype": "application/pdf", "size": 136700.0, "url": {"label": "SC-PR-SAKURAI-T-kaken -1p.pdf", "url": "https://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/record/54148/files/SC-PR-SAKURAI-T-kaken -1p.pdf"}, "version_id": "285bd9ff-b93c-44b6-8662-61cdb8d3bdc1"}]}, "item_keyword": {"attribute_name": "キーワード", "attribute_value_mlt": [{"subitem_subject": "一酸化窒素", "subitem_subject_scheme": "Other"}, {"subitem_subject": "一酸化窒素還元酵素", "subitem_subject_scheme": "Other"}, {"subitem_subject": "分子進化", "subitem_subject_scheme": "Other"}, {"subitem_subject": "キメラ", "subitem_subject_scheme": "Other"}, {"subitem_subject": "組換え体", "subitem_subject_scheme": "Other"}, {"subitem_subject": "ミュータント", "subitem_subject_scheme": "Other"}, {"subitem_subject": "酸素還元", "subitem_subject_scheme": "Other"}, {"subitem_subject": "膜タンパク質", "subitem_subject_scheme": "Other"}, {"subitem_subject": "脱窒", "subitem_subject_scheme": "Other"}, {"subitem_subject": "嫌気呼吸", "subitem_subject_scheme": "Other"}, {"subitem_subject": "好気呼吸", "subitem_subject_scheme": "Other"}]}, "item_language": {"attribute_name": "言語", "attribute_value_mlt": [{"subitem_language": "jpn"}]}, "item_resource_type": {"attribute_name": "資源タイプ", "attribute_value_mlt": [{"resourcetype": "research report", "resourceuri": "http://purl.org/coar/resource_type/c_18ws"}]}, "item_title": "一酸化窒素還元から酸素還元への変換による呼吸酵素の分子進化", "item_titles": {"attribute_name": "タイトル", "attribute_value_mlt": [{"subitem_title": "一酸化窒素還元から酸素還元への変換による呼吸酵素の分子進化"}]}, "item_type_id": "9", "owner": "18", "path": ["2828"], "permalink_uri": "https://doi.org/10.24517/00060425", "pubdate": {"attribute_name": "公開日", "attribute_value": "2021-02-22"}, "publish_date": "2021-02-22", "publish_status": "0", "recid": "54148", "relation": {}, "relation_version_is_last": true, "title": ["一酸化窒素還元から酸素還元への変換による呼吸酵素の分子進化"], "weko_shared_id": -1}
一酸化窒素還元から酸素還元への変換による呼吸酵素の分子進化
https://doi.org/10.24517/00060425
https://doi.org/10.24517/00060425f3a9d754-5ac2-4ba0-a47b-a0f3c208e402
名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
---|---|---|
SC-PR-SAKURAI-T-kaken -1p.pdf (136.7 kB)
|
Item type | 報告書 / Research Paper(1) | |||||
---|---|---|---|---|---|---|
公開日 | 2021-02-22 | |||||
タイトル | ||||||
タイトル | 一酸化窒素還元から酸素還元への変換による呼吸酵素の分子進化 | |||||
言語 | ||||||
言語 | jpn | |||||
資源タイプ | ||||||
資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18ws | |||||
資源タイプ | research report | |||||
ID登録 | ||||||
ID登録 | 10.24517/00060425 | |||||
ID登録タイプ | JaLC | |||||
著者 |
櫻井, 武
× 櫻井, 武 |
|||||
著者別表示 |
Sakurai, Takeshi
× Sakurai, Takeshi |
|||||
提供者所属 | ||||||
内容記述タイプ | Other | |||||
内容記述 | 金沢大学金沢大学理工研究域物質化学系 | |||||
書誌情報 |
平成17(2005)年度 科学研究費補助金 萌芽研究 研究概要 en : 2005 Research Project Summary 巻 2004 – 2005, p. 1p., 発行日 2016-04-21 |
|||||
抄録 | ||||||
内容記述タイプ | Abstract | |||||
内容記述 | 脱窒菌Halomonas halodenitrificansはヘムcを有する小サブユニットNorCと低スピンヘムb,高スピンヘムb_3および非ヘム鉄を有する大サブユニットNorBからなるヘテロダイマーコンプレックスである。大腸菌を宿主としてNorCを異種発現したところ,N末の膜アンカーが切断された状態で発現したが,ヘムcを含む部分には影響なく,電子移動機能を有していた。同様に,NorBを大腸菌を宿主として異種発現させたが,一酸化窒素還元機能は示さず,サブユニットの個別発現には成功しなかった。そこで,NorBの発現には,成熟酵素には存在しないORFがコードするNorQ, NorDが関係すると考え,この遺伝子も含めて発現系を構築したが,機能のある酵素は発現しなかった。次いで,H.halodenitrificans遺伝子がコードする総てのNOR遺伝子,NorC, NorB, NorQ, NorDを含んだ異種発現系を構築したところ,オーセンティックなNorと同じ吸収,MCD, ESRスペクトルを示す組換え体が得られた。この組換え体のNO還元活性を測定したところ,微弱ながら,活性を示し,世界で初めてNorの異種発現に成功した。次いで,Norが末端酸化酵素へと分子進化する過程を再現するため,非ヘム鉄を銅結合部位に変異させることを計画し,Norとチトクロムオキシダーゼのキメラ酵素の作成を試みたが,キメラ酵素は高次構造を適切にとることが出来なかった。この解決方法として,組換え体を点変異させることが計画されるが,異種発現体は酵素の収量が低いことから,研究期間内ではミュータントの作成までには至らなかった。異種及び同種発現によるミュータント作成は新しい大きなテーマとして設定する計画である。 | |||||
内容記述 | ||||||
内容記述タイプ | Other | |||||
内容記述 | 研究課題/領域番号:16655069, 研究期間(年度):2004 – 2005 | |||||
内容記述 | ||||||
内容記述タイプ | Other | |||||
内容記述 | 出典:「一酸化窒素還元から酸素還元への変換による呼吸酵素の分子進化」研究成果報告書 課題番号16655069 (KAKEN:科学研究費助成事業データベース(国立情報学研究所)) (https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-16655069/)を加工して作成 |
|||||
著者版フラグ | ||||||
出版タイプ | AM | |||||
出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa | |||||
関連URI | ||||||
識別子タイプ | URI | |||||
関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/ja/search/?kw=90116038 | |||||
関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/ja/search/?kw=90116038 | |||||
関連URI | ||||||
識別子タイプ | URI | |||||
関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-16655069/ | |||||
関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-16655069/ |