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Identification of Genotypes of Giardia intestinalis Isolates from Dogs in Japan by Direct Sequencing of the PCR Amplified Glutamate Dehydrogenase Gene(Parasitology)
http://hdl.handle.net/2297/32518
http://hdl.handle.net/2297/32518cab72974-6b31-4cac-ba52-0e0f1b4c1f2e
名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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![]() |
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Item type | 学術雑誌論文 / Journal Article(1) | |||||
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公開日 | 2017-10-03 | |||||
タイトル | ||||||
タイトル | Identification of Genotypes of Giardia intestinalis Isolates from Dogs in Japan by Direct Sequencing of the PCR Amplified Glutamate Dehydrogenase Gene(Parasitology) | |||||
言語 | ||||||
言語 | eng | |||||
資源タイプ | ||||||
資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||
資源タイプ | journal article | |||||
その他のタイトル | ||||||
値 | Giardia glutamate dehydrogenase遺伝子のダイレクトシーケンス法による犬由来Giardia intestinalis株の遺伝子型の同定(寄生虫病学) | |||||
著者 |
Abe, Niichiro
× Abe, Niichiro× Kimata, Isao× Iseki, Motohiro |
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書誌情報 |
The journal of veterinary medical science 巻 65, 号 1, p. 29-33, 発行日 2003-01-25 |
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ISSN | ||||||
収録物識別子タイプ | ISSN | |||||
収録物識別子 | 0916-7250 | |||||
NCID | ||||||
収録物識別子タイプ | NCID | |||||
収録物識別子 | AA10796138 | |||||
DOI | ||||||
関連タイプ | isIdenticalTo | |||||
識別子タイプ | DOI | |||||
関連識別子 | https://doi.org/10.1292/jvms.65.29 | |||||
出版者 | ||||||
出版者 | 日本獣医学会 = Japanese Society of Veterinary Science | |||||
抄録 | ||||||
内容記述タイプ | Abstract | |||||
内容記述 | Giardia intestinalisは人や動物の下痢症の原因として知られている原虫である.最近の分子生物学的研究により,本種は形態的に区別できない人獣共通寄生性の遺伝子型と人以外の動物から特異に見出される遺伝子型より構成されることが明らかとなっている.犬からは犬に特異的な遺伝子型のみならず人獣共通寄生性の遺伝子型も検出されていることから,遺伝子型を鑑別することは人への感染を予防する上で重要である.本調査では犬からの4分離株について,Giardia glutamate dehydrogenase(GDH)遺伝子のダイレクトシーケンス法により遺伝子型別を行った.著者らが作製したGDH遺伝子を増幅するプライマーペア(GDHF3とGDHB5)は,Giardiaに特異的であり,増幅産物のダイレクトシーケンスから,4株のシーケンスは各々一致することを確認した.また,4株のシーケンスは犬に特異的な遺伝子型Assemblage CあるいはDのシーケンスと15あるいは1塩基対異なっており,GDH遺伝子の系統樹を比較したところ,4株はAssemblage Dのクラスターに分類された.Giardiaの遺伝子型別の報告は国内では今回が最初であり,今回作製したプライマーによるダイレクトシーケンス法は,人獣共通寄生性の遺伝子型と犬に特異な遺伝子型との鑑別に有効な方法と考えられた. Giardia has been detected in domestic dogs in Japan, but the genotype of isolates has remained unclear because identification has relied on conventional microscopy. Here we tried to identify the genotypes of four isolates from dogs in Japan by direct sequencing of the PCR amplified Giardia glutamate dehydrogenase (GDH) gene. The primer pair GDHF3 and GDHB5, targeting the GDH gene, was designed to prime a region of the GDH gene sequence conserved in the strains found to have the dog-specific genotype. The specific PCR product (approximately 220 bp), amplified with this primer pair, was only observed when Giardia DNA was used as the template. The sequences of the diagnostic fragments were identical among the isolates from dogs, and were differed by 15 bp or 1 bp from the strains, which were found to be the dog-specific genotypes, Assemblage C or D respectively. To verify the identity of the amplified DNA, a phylogenetic analysis was performed. Consequently, the sequence of the isolates from dogs clearly clustered with the strain found to be Assemblage D with neighbor-joining analyses. Therefore, all the isolates from dogs examined were identified as the dog-specific genotype, Assemblage D. In the present study, we revealed the genotype of Giardia isolates in Japan, and showed that direct sequencing of the PCR product amplified with the primer pair GDHF3 and GDHB5 was a useful tool for distinguishing between the zoonotic and dog-specific genotypes. | |||||
権利 | ||||||
権利情報 | 日本獣医学会 | 本文データは学協会の許諾に基づきCiNiiから複製したものである | |||||
著者版フラグ | ||||||
出版タイプ | VoR | |||||
出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||
関連URI | ||||||
識別子タイプ | URI | |||||
関連識別子 | http://jsvetsci.jp/ | |||||
関連URI | ||||||
識別子タイプ | URI | |||||
関連識別子 | http://ci.nii.ac.jp/naid/110003886099 |