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単細胞トランスクリプトームによる細胞階層性構造の解明
https://doi.org/10.24517/00051560
https://doi.org/10.24517/00051560b697a177-d5f4-4116-9432-2fadfc58204f
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
ME-PR-HASHIMOTO-S-kaken 2016-4p.pdf (349.0 kB)
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.png)
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| Item type | 報告書 / Research Paper(1) | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2018-07-09 | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | 単細胞トランスクリプトームによる細胞階層性構造の解明 | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | Classification of the cell hierarchy structure by single cell transcriptome | |||||
| 言語 | en | |||||
| 言語 | ||||||
| 言語 | jpn | |||||
| 資源タイプ | ||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18ws | |||||
| 資源タイプ | research report | |||||
| ID登録 | ||||||
| ID登録 | 10.24517/00051560 | |||||
| ID登録タイプ | JaLC | |||||
| 著者 |
橋本, 真一
× 橋本, 真一 |
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| 提供者所属 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 金沢大学医薬保健学総合研究科 | |||||
| 書誌情報 |
平成27(2015)年度 科学研究費補助金 基盤研究(B) 研究成果報告書 en : 2015 Fiscal Year Final Research Report 巻 2013-04-01 - 2016-03-31, p. 4p., 発行日 2016-09-15 |
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| 抄録 | ||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||
| 内容記述 | 細胞集団の１細胞ずつの性格を明らかにし、真の細胞状態を把握することは生物学の研究にとって非常に重要である。本研究では微量／１細胞トランスクリプトーム解析法を開発し、がん細胞や免疫細胞の細胞集団の階層性を明らかにし、真の細胞状態を把握することで将来的に臨床研究に役立てることを目的とする。本研究では単一細胞遺伝子発現解析の発展系として数百以上の1細胞の遺伝子発現を同時に観察出来る革新的な技術(Nx1-seq)を開発した。この方法を用いて新たにがん細胞株、免疫細胞の１細胞遺伝子解析を行い有用性を確認した。 | |||||
| 抄録 | ||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||
| 内容記述 | A tissue, an organ, or even a differentiated state of cells are composed of heterogeneous cell populations. Single-cell gene-expression profiling allows you to identify and characterize various types of each cell. Here, we have developed the novel strategy (Nx1-seq) of single-cell transcriptome analysis for thousands of single cells. In our approach, single cells are deposited in a high-density microwell plate and lysed in situ. mRNA is then captured on barcoding microbeads developed by emulsion PCR and reverse transcribed. By applying this Nx1seq method for thousands of cells per experiment, we have successfully characterized 1) complex heterogeneous types of cells in the human endometrioid adenocarcinoma cancer cell line and 2) immune cells at a certain differentiated state. | |||||
| 内容記述 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 研究課題/領域番号:25290071, 研究期間(年度):2013-04-01 - 2016-03-31 | |||||
| 内容記述 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 出典：研究課題「単細胞トランスクリプトームによる細胞階層性構造の解明」課題番号25290071 （KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所）） （https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-25290071/25290071seika/）を加工して作成 |
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| 著者版フラグ | ||||||
| 出版タイプ | AM | |||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa | |||||
| 関連URI | ||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/search/?qm=00313099 | |||||
| 関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/search/?qm=00313099 | |||||
| 関連URI | ||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25290071/ | |||||
| 関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25290071/ | |||||
| 関連URI | ||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-25290071/25290071seika/ | |||||
| 関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-25290071/25290071seika/ | |||||
