@techreport{oai:kanazawa-u.repo.nii.ac.jp:00046198, month = {Jun}, note = {次世代シーケンサーを用いて、系統学的に枢要な位置にある生物の転写産物とゲノム両方のシーケンシングを行う事で、これまで困難であった古い分岐順序を統計的に高い信頼性をもって推定する事ができるようにすることを目指して研究を進めた。ゲノムサイズが400 Mb以下程度の生物については核ゲノムまで決定する事が現実的に可能であることがわかった。ゲノム配列を決定する事は、発現量の低い遺伝子、全長の長い遺伝子までデータを取得する事を考えるとかえって安価であるかもしれない。, This research aimed at sequencing both the genome and the transcriptome of organisms that occupy pivotal position in the phylogeny to allow resolution of difficult phylogenetic problems such as deep branches with high statistical confidence. A liverwort species, Jungermannia infusca, with an estimated genome size of 386 Mb was sequenced and assembled, indicating that sequencing nuclear genome of less than 400 Mb is realistically doable, and could be less expensive than focusing RNA-seq when one want to obtain low-expression level genes and very long transcripts., 研究課題/領域番号:23657063, 研究期間(年度):2011-2012, 出典:研究課題「次世代シーケンサーによる系統解析の革新」課題番号23657063 (KAKEN:科学研究費助成事業データベース(国立情報学研究所)) (https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-23657063/23657063seika/)を加工して作成}, title = {次世代シーケンサーによる系統解析の革新}, year = {2014} }