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新規ポリＡ鎖長決定法を用いた翻訳と転写を結ぶ遺伝子発現制御プラットフォームの構築
https://doi.org/10.24517/00056611
https://doi.org/10.24517/0005661189c0aa34-581d-4cdb-a0d9-fb414bdcdaf2
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
SC-PR-TEI-H-kaken 2014-4p.pdf (82.3 kB)
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.png)
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| Item type | 報告書 / Research Paper(1) | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2020-01-27 | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | 新規ポリＡ鎖長決定法を用いた翻訳と転写を結ぶ遺伝子発現制御プラットフォームの構築 | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | Construction of a transcriptional-translational regulation platform using a novel poly(A) determination method | |||||
| 言語 | en | |||||
| 言語 | ||||||
| 言語 | jpn | |||||
| 資源タイプ | ||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18ws | |||||
| 資源タイプ | research report | |||||
| ID登録 | ||||||
| ID登録 | 10.24517/00056611 | |||||
| ID登録タイプ | JaLC | |||||
| 著者 |
程, 肇
× 程, 肇 |
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| 書誌情報 |
平成24(2012)年度 科学研究費補助金 挑戦的萌芽研究 研究成果報告書 en : 2013 Fiscal Year Final Research Report 巻 2012-04-01 - 2013-03-31, p. 4p., 発行日 2014-06-02 |
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| 出版者 | ||||||
| 出版者 | 金沢大学理工研究域生命理工学系 | |||||
| 抄録 | ||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||
| 内容記述 | 新規な真核生物のmRNAポリA鎖決定法であるPACHINCO RT-PCR 法を構築した。そして、本方法を全自動型DNA分析用マイクロチップ電気泳動装置に適用するための条件の最適化を実施した。その結果、実際にLarkによる哺乳類時計遺伝子Per1 mRNA のポリA鎖伸長を、明快に確認することができた。さらにスループット性と、ポリA鎖長の分析精度を飛躍的に高めることを目的に、この方法を大規模シークエンサへ適用することを試みた。その結果、ラット視交叉上核由来細胞とマウス視交叉上核細胞において、多数のポリA 鎖長に概日リズムが見られるmRNAを集積することができた。 | |||||
| 抄録 | ||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||
| 内容記述 | I have constructed a novel method for the determination of poly(A) in eukaryotic mRNA, and designated as PACHINCO RT-PCR. The method was optimized for the application of automatic microchip DNA sequencers, and the elongation of the poly(A) of Per1 clock gene transcripts was clearly determined. Subsequently, the method was applied for NGS sequencers for the improvement of the throughput and analytical precision for poly(A) determination. Accordingly, I have collected mRNAs with the circadian oscillation of poly(A) length in both a rat suprachiasmatic nucleus derived cell line and mouse suprachiasmatic cells. | |||||
| 内容記述 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 研究課題/領域番号:24651212, 研究期間(年度):2012-04-01 - 2013-03-31 | |||||
| 内容記述 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 出典：研究課題「新規ポリＡ鎖長決定法を用いた翻訳と転写を結ぶ遺伝子発現制御プラットフォームの構築」課題番号24651212 （KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所）） （https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-24651212/24651212seika/)を加工して作成 |
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| 著者版フラグ | ||||||
| 出版タイプ | AM | |||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa | |||||
| 関連URI | ||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/search/?qm=00242115 | |||||
| 関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/search/?qm=00242115 | |||||
| 関連URI | ||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24651212/ | |||||
| 関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24651212/ | |||||
| 関連URI | ||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-24651212/24651212seika/ | |||||
| 関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-24651212/24651212seika/ | |||||
