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情報工学的なデータベース横断解析法に基づく翻訳アレスト配列の全貌解明
https://doi.org/10.24517/00057740
https://doi.org/10.24517/000577409a7fdd88-1081-479f-8d8b-9605f2e24d76
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
PH-PR-TAKAHASHI-H-kaken 2022-5p.pdf (351.4 kB)
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.png)
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| Item type | 報告書 / Research Paper(1) | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2023-02-27 | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | 情報工学的なデータベース横断解析法に基づく翻訳アレスト配列の全貌解明 | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | Elucidation of translation-arresting sequences in genomes using computer-based intersectional analyses of life science databases | |||||
| 言語 | en | |||||
| 言語 | ||||||
| 言語 | jpn | |||||
| 資源タイプ | ||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18ws | |||||
| 資源タイプ | research report | |||||
| ID登録 | ||||||
| ID登録 | 10.24517/00057740 | |||||
| ID登録タイプ | JaLC | |||||
| 著者 |
髙橋, 広夫
× 髙橋, 広夫 |
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| 提供者所属 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 金沢大学医薬保健研究域薬学系 | |||||
| 書誌情報 |
令和2(2020)年度 科学研究費補助金 基盤研究(B) 研究課題概要 en : 2020 Research Project Summary 巻 2018 – 2020, p. 5p., 発行日 2022-04-15 |
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| 抄録 | ||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||
| 内容記述 | Upstream Open Reading Frame (uORF)は、AUG以外の開始コドンから翻訳が始まる非AUG開始型uORFが存在する。そのような非AUG開始型uORFの中で翻訳アレストを起こすものを同定するために、ESUCAパイプラインを改変して進化的に保存された配列を持つ非AUG開始型uORFを動植物のゲノムから探索した。その結果、そのような非AUG開始型uORFが14個同定された。それらの中から、主要ORFの翻訳制御に関与するものを一過的発現解析により4個同定した。また、胃がん発症機構解明のため、本年度は、高度遺伝子増幅領域内の遺伝子発現がプロモーターのメチル化と関連しているか、メチロームデータとの3層オミクス統合解析を行い、遺伝子の発現量とメチル化の間に、強い相関があることを見出した。遺伝子増幅に伴って過剰発現する遺伝子にはGATA6のような新たながん遺伝子が多く、発現が低下している遺伝子にはGSDMAのようながん抑制遺伝子が含まれていた。これらにより、3層オミクス統合解析によって、腹膜転移性胃がんの増幅遺伝子の全体像が明らかになった。 | |||||
| 内容記述 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 研究課題/領域番号:18H03330, 研究期間(年度):2018 – 2020 | |||||
| 内容記述 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 出典：「情報工学的なデータベース横断解析法に基づく翻訳アレスト配列の全貌解明」研究成果報告書 課題番号18H03330 （KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所）） （https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18H03330/)を加工して作成 |
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| 著者版フラグ | ||||||
| 出版タイプ | AM | |||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa | |||||
| 関連URI | ||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/search/?qm=30454367 | |||||
| 関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/search/?qm=30454367 | |||||
| 関連URI | ||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18H03330/ | |||||
| 関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18H03330/ | |||||
