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Molecular dynamics study of hydration water behavior in blue copper protein
https://doi.org/10.24517/00010140
https://doi.org/10.24517/00010140af8cba4f-7104-4ec0-8f46-0f102412c53c
名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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![]() |
Item type | 学術雑誌論文 / Journal Article(1) | |||||||||
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公開日 | 2017-10-03 | |||||||||
タイトル | ||||||||||
タイトル | Molecular dynamics study of hydration water behavior in blue copper protein | |||||||||
言語 | ||||||||||
言語 | eng | |||||||||
資源タイプ | ||||||||||
資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||
資源タイプ | journal article | |||||||||
ID登録 | ||||||||||
ID登録 | 10.24517/00010140 | |||||||||
ID登録タイプ | JaLC | |||||||||
著者 |
Sugiyama, Ayumu
× Sugiyama, Ayumu× Takamatsu, Yuichiro× Purqon, Acep× Mizukami, Taku× Nagao, Hidemi× Nishikawa, Kiyoshi |
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著者別表示 |
長尾, 秀実
× 長尾, 秀実
× 西川, 清
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提供者所属 | ||||||||||
内容記述タイプ | Other | |||||||||
内容記述 | 金沢大学大学院自然科学研究科計算科学 | |||||||||
提供者所属 | ||||||||||
内容記述タイプ | Other | |||||||||
内容記述 | 金沢大学理学部 | |||||||||
書誌情報 |
AIP Conference Proceedings 巻 832, p. 570-573, 発行日 2006-05-01 |
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ISSN | ||||||||||
収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||
収録物識別子 | 0094-243X | |||||||||
DOI | ||||||||||
関連タイプ | isIdenticalTo | |||||||||
識別子タイプ | DOI | |||||||||
関連識別子 | https://doi.org/10.1063/1.2204567 | |||||||||
出版者 | ||||||||||
出版者 | American Institute of Physics | |||||||||
抄録 | ||||||||||
内容記述タイプ | Abstract | |||||||||
内容記述 | We carry out the molecular dynamics(MD) simulation of type 1 blue copper protein azurin in room and some lower temperatures to investigate the behavior of hydration water molecules in the protein surface. In this study, we find the anomalous behavior of the water molecules, which depend on the system temperatures. These water molecules have hydrogen bond to the protein surface residues. We specify the residues type, being classified as the hydration donor and the hydration acceptor of water molecules. We analyze the residue type, and the bond length and bond strength between solvent water molecules in each temperature. Moreover, we estimate the B-factor of these residues which indicates the fluctuation of hydration residues in each temperature. B-factor values depend on the system temperatue althought the number of hydration residue do not depend on the temperature. © 2006 American Institute of Physics. | |||||||||
著者版フラグ | ||||||||||
出版タイプ | VoR | |||||||||
出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 |