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4Dライブセルイメージングデータ内の非常に多数の細胞の自動追跡手法の開発
https://doi.org/10.24517/00052186
https://doi.org/10.24517/000521865ffc7a1e-1ff6-44c2-9605-cc50487e63e9
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
TE-PR-HIROSE-O-kaken 2018-5p.pdf (341.9 kB)
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.png)
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| Item type | 報告書 / Research Paper(1) | |||||
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| 公開日 | 2019-04-22 | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | 4Dライブセルイメージングデータ内の非常に多数の細胞の自動追跡手法の開発 | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | Automatic tracking of multiple cell regions in 4D live-cell imaging data | |||||
| 言語 | en | |||||
| 言語 | ||||||
| 言語 | jpn | |||||
| 資源タイプ | ||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18ws | |||||
| 資源タイプ | research report | |||||
| ID登録 | ||||||
| ID登録 | 10.24517/00052186 | |||||
| ID登録タイプ | JaLC | |||||
| 著者 |
広瀬, 修
× 広瀬, 修 |
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| 提供者所属 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 金沢大学理工研究域生命理工学系 | |||||
| 書誌情報 |
平成29(2017)年度 科学研究費補助金 若手研究(B) 研究成果報告書 en : 2017 Fiscal Year Final Research Report 巻 2015-04-01 - 2018-03-31, p. 5p., 発行日 2018-09-04 |
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| 抄録 | ||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||
| 内容記述 | 本研究で4Dライブセルイメージングデータ内の非常に多数の細胞を自動追跡するための基盤技術の開発を目指した．細胞動画像の典型的な特徴のひとつとして，多数の細胞が密に存在し視覚的に類似している．標準的な追跡手法を利用した場合，本来追跡すべき細胞を別の細胞と誤認し追跡に失敗する．この問題に対し，細胞の運動は近隣の細胞の位置や運動に依存するという空間的依存性に着目し，追跡のための補助的な情報としてこれを利用することで追跡精度の向上を目指した．課題研究を順調に遂行することができ，高速かつ高精度で細胞の追跡を行うことのできるソフトウェアの開発に成功した． | |||||
| 抄録 | ||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||
| 内容記述 | In this research, we aimed at developing the methods for automating the detection and tracking of cell regions in 4D live-cell imaging data. Cells in 4D live-cell imaging data are often imaged as ellipsoidal shapes and are densely distributed. For this data, standard methods usually fail to automatic tracking because of cell-switching and coalescence of tracked positions. To address this issue, we utilized typical characteristics in 4D live-cell imaging data; movements of nearly-located cells are strongly correlated. By using the characteristics used as the information for predicting cells' positions, we succeeded to improve tracking performance drastically. The software developed in this research is being distributed on the project website. | |||||
| 内容記述 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 研究課題/領域番号:15K16021, 研究期間(年度):2015-04-01 - 2018-03-31 | |||||
| 内容記述 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 出典：研究課題「4Dライブセルイメージングデータ内の非常に多数の細胞の自動追跡手法の開発」課題番号15K16021 （KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所）） （https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-15K16021/15K16021seika/)を加工して作成 |
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| 著者版フラグ | ||||||
| 出版タイプ | AM | |||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa | |||||
| 関連URI | ||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/search/?qm=30549671 | |||||
| 関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/search/?qm=30549671 | |||||
| 関連URI | ||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15K16021/ | |||||
| 関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15K16021/ | |||||
| 関連URI | ||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-15K16021/15K16021seika/ | |||||
| 関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-15K16021/15K16021seika/ | |||||
