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高速AFMで明らかにする真正細菌型イオンポンプロドプシンの多量体構造と機能動態
https://doi.org/10.24517/00059969
https://doi.org/10.24517/00059969b6aabe93-f0fa-4b8f-9574-aa83d53e9068
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
SC-PR-UCHIHASHI-T-kaken 2018b-3p.pdf (240.3 kB)
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.png)
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| Item type | 報告書 / Research Paper(1) | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2020-12-14 | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | 高速AFMで明らかにする真正細菌型イオンポンプロドプシンの多量体構造と機能動態 | |||||
| 言語 | ||||||
| 言語 | jpn | |||||
| 資源タイプ | ||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18ws | |||||
| 資源タイプ | research report | |||||
| ID登録 | ||||||
| ID登録 | 10.24517/00059969 | |||||
| ID登録タイプ | JaLC | |||||
| その他のタイトル | ||||||
| その他のタイトル | 理論と実験の協奏による柔らかな分子系の機能の科学 | |||||
| その他のタイトル | ||||||
| その他のタイトル | Science on Function of Soft Molecular Systems by Cooperation of Theory and Experiment | |||||
| 著者 |
内橋, 貴之
× 内橋, 貴之 |
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| 提供者所属 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 名古屋大学 / 金沢大学理工学域数物科学系 | |||||
| 書誌情報 |
平成29(2017)年度 科学研究費補助金 新学術領域研究(研究領域提案型) 研究実績の概要 en : 2017 Research Project Summary 巻 2016-04-01 – 2018-03-31, p. 3p., 発行日 2018-12-17 |
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| 抄録 | ||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||
| 内容記述 | １．イオンポンプロドプシンの多量体構造の決定: 様々な微生物型ロドプシンを高速AFM法と円二色性(CD)分光法により網羅的に解析し、脂質膜に再構成された状態での多量体構造を決定した。高速AFM観察により、GR、KR2、FR、KrActR、QsActR等の真性細菌で見出された微生物型ロドプシンはリング状の5量体を形成しており、GPRは５量体と６量体が共存していることがわかった。また、センサリーロドプシンであるSRII、ハロロドプシンNpHRなどの古細菌型ロドプシンは三量体であることがわかった。一方、内向きH+ポンプであるPoXeRやセンサリーロドプシンASRは真性細菌で発見された微生物型ロドプシンであるが、アミノ酸残基の相同性からは古細菌型に分類され、実際多量体構造は三量体であった。また、CD分光で観察される三量体と五量体に特徴的なスペクトルは多量体構造に依存したレチナールの配向で説明できることもわかった。これらの結果から、微生物型プロドプシンの多量体構造は進化系統樹と深く関わっている一方、イオンポンプのイオン種や向きと相関がないことがわかった。 2．KR2の光誘起構造変化の観察の観察: 外向きNa+ポンプであるKR2の光誘起による構造変化の観察に向けて、KR2五量体の観察面の決定およい高解像観察に適した試料の調製を行った。野生型に比べて光サイクルが100以上遅いN112A変異体を高解像観察しながら、周期的な光照射を照射したが明瞭な構造変化は観察できなかった。このことから、BRとは異なり、KR2の光サイクル中には大規模な構造変化は起きていない可能性が示唆された。 |
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| 内容記述 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 研究課題/領域番号:16H00830, 研究期間(年度):2016-04-01 – 2018-03-31 | |||||
| 内容記述 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 出典：研究課題「高速AFMで明らかにする真正細菌型イオンポンプロドプシンの多量体構造と機能動態」課題番号16H00830 （KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所）） （https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PUBLICLY-16H00830/)を加工して作成 |
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| 著者版フラグ | ||||||
| 出版タイプ | AM | |||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa | |||||
| 関連URI | ||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/ja/search/?kw=30326300 | |||||
| 関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/ja/search/?kw=30326300 | |||||
| 関連URI | ||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PUBLICLY-16H00830/ | |||||
| 関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PUBLICLY-16H00830/ | |||||
| 関連URI | ||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-AREA-2503/ | |||||
| 関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-AREA-2503/ | |||||
| 関連URI | ||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-AREA-2503/ | |||||
| 関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-AREA-2503/ | |||||
