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16SrRNA解析を用いた検体からの細菌同定
https://doi.org/10.24517/00060644
https://doi.org/10.24517/000606449c15674e-312e-40e4-b19c-44e5559e6a4f
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
HO-PR-SAKAI-Y-kaken 2021-1p.pdf (120.6 kB)
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.png)
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| Item type | 報告書 / Research Paper(1) | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2021-06-18 | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | 16SrRNA解析を用いた検体からの細菌同定 | |||||
| 言語 | ||||||
| 言語 | jpn | |||||
| 資源タイプ | ||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18ws | |||||
| 資源タイプ | research report | |||||
| ID登録 | ||||||
| ID登録 | 10.24517/00060644 | |||||
| ID登録タイプ | JaLC | |||||
| 著者 |
坂井, 優喜子
× 坂井, 優喜子 |
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| 提供者所属 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 金沢大学附属病院 | |||||
| 書誌情報 |
平成28(2016)年度 科学研究費補助金 奨励研究 研究概要 en : 2016 Research Project Summary 巻 2016, p. 1p., 発行日 2021-04-25 |
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| 抄録 | ||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||
| 内容記述 | 1. 研究目的 細菌培養検査では感染症が強く疑われるにも関わらず培養陰性となることがある。この理由として、抗菌薬の影響、検体の輸送や保存中の菌の死滅、培養に特殊な条件を要する(ガス濃度、温度、時間、培地)、人工培地での発育が困難など考えられる。そこで本研究では、感染症を強く疑うが培養陰性であった検体から、細菌の検出と同定を行うことを目的とした。 2. 研究方法 感染症を疑うが細菌培養陰性であった検体24件を対象とした。検体の内訳は膿瘍5件、腹水5件、関節液4件、胸水4件、リコール2件、骨髄腔、骨、腎のう胞内容物、リンパ各1件であった。検体からDNAを抽出後(MORA-EXTRACT、極東)、16S rRNA領域をPCRにて増幅し、1%アガロースゲル電気泳動にて増幅産物(1.5kbp)の有無を確認した。1.5kbpのバンドを認めない場合はここまでとし、認めた場合は増幅産物の精製(Wizard SV Gel and PCR Clean-Up System、プロメガ)、シーケンス、相同性検索(BLAST、BIBI、Ex Taxon)を行い微生物の同定を行った。 3. 主な研究成果 24件中9検体で微生物が同定された。検体の内訳は、膿瘍、腹水が各2件、胸水、関節液、骨髄腔、リコール、腎のう胞内容液が各1件であった。検出菌は、膿瘍からStaphylococcus sp. 、Streptococcus sp. 、腹水からParvimonas micra、Streptococcus sp. 、胸水からProteus sp. 、関節液からStaphylococcus sp. 、骨髄腔からActinomyces sp. 、腎のう胞内溶液からPropionibacterium acnes、リコールから腸内細菌が同定された。培養陰性要因として、検体採取前の抗菌薬投与が5件、55.6%を占めた。培養条件不適例や人工培地での発育困難例は認めず、他4件は培養陰性となった要因が不明であった。 |
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| 内容記述 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 研究課題/領域番号:16H00641, 研究期間(年度):2016 | |||||
| 内容記述 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 出典：「16SrRNA解析を用いた検体からの細菌同定」研究成果報告書 課題番号16H00641 （KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所）） （https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16H00641/）を加工して作成 |
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| 著者版フラグ | ||||||
| 出版タイプ | AM | |||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa | |||||
| 関連URI | ||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16H00641/ | |||||
| 関連名称 | https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16H00641/ | |||||
